《火焰纹章 新纹章之谜 光与影的英雄》是《火焰纹章 纹章之谜》第2部的重制版，透过英雄马尔斯与无名青年骑士两人的观点，展开经典的传奇故事。游戏的故事背景设定在前作《火焰纹章 新暗黑龙与光之剑》的“暗黑战争”结束后1年，玩家将扮演憧憬英雄马尔斯而成为骑士的青年，通过自创的“个人单位(マイユニット)”虚拟分身角色与英雄马尔斯一行人并肩作战，体验多采多姿的故事剧情。