2047年，Tiberium矿石——一种类似冰河时代自我繁衍的外星矿物质疯狂的污染了地球，作为世界发达国家联盟的高科技组织GDI，他们一直在跟Tiberium斗争，而NOD兄弟会的疯狂领袖Kane也有他自己的阴谋，他的秘密组织试图利用Tiberium来控制人类社会，打造他的世界霸权。《命令与征服：泰伯利亚战争》的故事和战争依然围绕Tiberium的争夺而展开。