本作将由5个章节构成，其中之还有一段隐藏故事（第5话），这段故事也是连接GBA版《逆转裁判》1和2的重要剧情。届时在《逆转裁判2》中谜一般的的“失踪事件”将最终水落石出。本作的系统和全系列共通，仍旧由侦探和法庭辩护两部分组成。而利用NDS的全新机能，在进行侦探活动时，通过点击下方的触摸屏可以进行各种调查活动。此外还将会有利用麦克风进行证据调查的新设定。同时，在法庭上出具的证物将以多边形来表现。当然，动画形式的证物也将首次出现。